科研進(jìn)展
伊蚊是登革病毒、黃熱病毒、基孔肯亞病毒等多種病毒的重要傳播媒介。蚊蟲(chóng)中腸既是其消化血餐和吸收營(yíng)養的器官,還是病毒感染蚊蟲(chóng)并復制增殖的初始靶器官,在蚊蟲(chóng)傳播病毒和防御病毒中起雙重作用,是研究蚊蟲(chóng)-病毒相互作用的重要模型。蚊蟲(chóng)傳播病毒的關(guān)鍵因素之一是中腸細胞對病毒的易感性,而中腸細胞的異質(zhì)性會(huì )影響病毒的感染和復制,因此在單細胞水平研究蚊蟲(chóng)感染傳播病毒的特征具有重要意義。但是目前針對埃及伊蚊仍缺乏可用的中腸單細胞轉錄組圖譜。
2024年6月6日,武漢病毒所袁志明、夏菡與耶魯大學(xué)醫學(xué)院崔穎俊合作在國際學(xué)術(shù)期刊Scientific Data在線(xiàn)發(fā)表了題為“A cell atlas of the adult female Aedes?aegypti midgut revealed by single-cell RNA sequencing”(《埃及伊蚊雌性成蚊中腸單細胞轉錄組圖譜》)的論文。
該研究選擇僅喂食葡萄糖水的7日齡成年雌性埃及伊蚊,解剖并收集其中腸,通過(guò)酶解離和密度梯度離心等方案制備成單細胞懸液并使用10x Genomics平臺進(jìn)行單細胞轉錄組測序(圖1),繪制了埃及伊蚊中腸單細胞圖譜。通過(guò)對單細胞的轉錄組特征進(jìn)行聚類(lèi)注釋得到腸干細胞/腸母細胞(ISC/EB)、賁門(mén)細胞(Cardia)、腸上皮細胞(EC)、類(lèi)腸上皮細胞(EC-like)、腸內分泌細胞(EE)和內臟肌細胞(VM) 等六類(lèi)腸道細胞(圖2)。此外,還明確了不同類(lèi)型細胞的標記基因(圖2)。本研究將為進(jìn)一步在單細胞水平上解析蚊蟲(chóng)感染和傳播病毒規律的研究奠定基礎。
武漢病毒所博士研究生汪順龍和博士后黃英為論文第一作者,袁志明研究員、夏菡青年研究員和耶魯大學(xué)醫學(xué)院崔穎俊副研究員為論文的通訊作者,海南大學(xué)教授韓謙為合作作者。該研究得到國家重點(diǎn)研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金等項目的資助。
圖1.埃及伊蚊中腸單細胞轉錄組分析流程。
圖2.埃及伊蚊中腸單細胞聚類(lèi)與注釋。(a)不同類(lèi)型中腸細胞的聚類(lèi);(b)不同類(lèi)型中腸細胞數量占比;(c)不同類(lèi)群中腸細胞的標記基因。
文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41597-024-03432-8